После упразднения губернии в 1782 году была организована так называемая Пограничная экспедиция под началом обер-коменданта Оренбурга. Вскоре Пограничную экспедицию переименовали в комиссию и отвели ей место во всю ширину квартала на Губернской улице (ул. Советская, 7). Именно в это время был возведён одноэтажный деревянный дом обер-коменданта с флигелем для приезжих знатных гостей — в пояснении к чертежам флигель указан как «покои порозжие».Обер-комендант — командная воинская или гражданская должность начальника крепости. Чин был введён императором Петром I. Обер-коменданты назначались только по провинциям, но далеко не везде. Иногда они исполняли должность вице-губернаторов и даже губернаторов, в случае их отсутствия.

Краевед В. В. Дорофеев, говоря о здании управлении коменданта, отмечает: «Пол был на более высокой отметке, чем у многих других домов, над уровнем грунта 120–130 см. <…> Вид у него гораздо строже, чем у Пограничной комиссии. Оконные проёмы обрамлены прямыми наличниками с ровными карнизами, на лицевом фасаде 9 проёмов, средний из них — дверной. Здесь, соответственно, крыльцо с навесом и ступеньками на обе стороны. Из сеней проход вёл только в одну сторону, где находилась приёмная, чтобы попасть в помещения с другой стороны от входа, нужно было обойти почти весь дом или идти со двора». В самой планировке строения было чётко выражено функциональное назначение — служить официальной приёмной. Людские избы и прочие служебные помещения находились во дворе.

С приходом военного губернатора В. А. Перовского в городе наметилась тенденция к реновации казённых построек, в число которых попал и дом обер-коменданта. Кирпичное оштукатуренное строение было решено в стилистике классицизма и отмечено датой завершения строительства — «1840».

Во второй половине XIX века расположенный рядом ордонансгауз и сам дом обер-коменданта по ходатайству генерал-губернатора Н. А. Крыжановского были отданы инженерным ведомством городу для размещения ремесленного училища.

Говоря о строениях, расположенных в непосредственной близости от бывшего управления коменданта, историк П. Н. Столпянский в начале ХХ столетия пишет: «По той же стороне дальше дом, отделанный в восточных традициях. Здесь теперь Киргизская учительская школа, открытая в 1890 г. Раньше дом был одноэтажный, в нём помещалась Пограничная комиссия. За ним следующий дом на углу Водяной улицы тоже принадлежал Пограничной комиссии, а теперь тут Тургайское областное правление. Когда-то, в XVIII в., здесь был дом “под именем хана”. Вероятно, в нём жил аманатом один из ханских сыновей».

В ХХ веке здание было приспособлено под коммунальное жильё. В настоящее время помещение эксплуатируется в качестве многоквартирного жилого дома.

Управление коменданта